2024

• Petton S., Pernet F., Le Roy V., Huber M., Martin S., Macé É., Bozec Y., Loisel S., Rimmelin-Maury P., Grossteffan É., Repecaud M., Quemener L., Retho M., Manac’h S., Papin M., Pineau P., Lacoue-Labarthe T., Deborde J., Costes L., Polsenaere P., Rigouin L., Benhamou J., Gouriou L., Lequeux J., Labourdette N., Savoye N., Messiaen G., Foucault E., Ouisse, V., Richard M., Lagarde F., Voron F., Kempf V., Mas S., Giannecchini L., Vidussi F., Mostajir B., Leredde Y., Alliouane S., Gattuso J.-P., and Gazeau F. (2024) “French coastal network for carbonate system monitoring: the CocoriCO2 dataset”, Earth Systems Science Data, 16, 1667–1688, https://doi.org/10.5194/essd-16-1667-2024
• Poppeschi, C., R. Verney, G. Charria. (2024). “Suspended particulate matter response to extreme forcings in the Bay of Seine”, Marine Geology, 472, 107292, https://doi.org/10.1016/j.margeo.2024.107292
• Verney R., Le Berre D., Repecaud M., Bocher A., Bescond T., Poppeschi C., Grasso F. (2024). “Suspended particulate matter dynamics at the interface between an estuary and its adjacent coastal sea: Unravelling the impact of tides, waves and river discharge from 2015 to 2022 in situ high-frequency observations”, Marine Geology, 471, 107281, https://doi.org/10.1016/j.margeo.2024.107281

2023

• Baudet J.B., Xuereb B., Danger M., Felten V., Duflot A., Maniez E., Le Foll F., Coulaud R. (2023). “Effects of temperature experienced during embryonic development on biomass and C and N composition at hatching in Palaemon serratus (Pennant, 1777)”. Acta Zoologica, 104, 677-685 https://doi.org/10.1111/azo.12461
• Fuchs R., Rossi V., Caille C., Bensoussan N., Pinazo C., Grosso O., Thyssen, M. (2023). “Intermittent upwelling events trigger delayed, major, and reproducible pico-nanophytoplankton responses in coastal oligotrophic waters”, Geophysical Research Letters, 50, e2022GL102651. https://doi.org/10.1029/2022GL102651
• Halawi Ghosn R., Poisson-Caillault E., Charria G., Bonnat A., Repecaud M., Facq J.-V., Quéméner L., Duquesne V., Blondel C., Lefebvre A. (2023). “MAREL Carnot data and metadata from Coriolis Data Center”, Earth System Science Data, 15, 4205-4218. https://doi.org/10.5194/essd-15-4205-2023
• Mertens K.N.l, Retho M., Manach S., Zoffoli M.L., Doner A., Schapira M., Bilien G., Séchet V., Lacour T., Robert E., Duval A., Terre-Terrillon A., Derrien A., Gernez P. (2023). “An unprecedented bloom of Lingulodinium polyedra on the French Atlantic coast during summer 2021”, Harmful Algae, 125, 102426, https://doi.org/10.1016/j.hal.2023.102426
• Petton S., Garnier V., Caillaud M., Debreu L., Dumas F. (2023). “Using the two-way nesting technique AGRIF with MARS3D V11.2 to improve hydrodynamics and estimate environmental indicators”, Geoscientific Model Development, 16, 1191–1211, https://doi.org/10.5194/gmd-16-1191-2023
• Salaün J., Menn M.L.(2023). “In Situ Calibration of Wetlabs Chlorophyll Sensors: A Methodology Adapted to Profile Measurements”, Sensors, 23, 2825. https://doi.org/10.3390/s23052825
• Simon A., Poppeschi C., Plecha S., Charria G., Russo A. (2023) “Coastal and regional marine heatwaves and cold spells in the northeastern Atlantic”, Ocean Science, 19, 1339–1355, https://doi.org/10.5194/os-19-1339-2023
• Toomey L., Giraldo C., Loots C., Mahé K., Marchal P., Mackenzie K. (2023).” Impact of temperature on Downs herring (Clupea harengus) embryonic stages: First insights from an experimental approach”. Plos One, 18(4), e0284125(28p.). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0284125
• Vissenaekens E., Guizien K., Durrieu De Madron X., Pairaud I., Leredde Y., Puig P., Bourrin F. (2023). “Accuracy of high resolution coastal flow speed simulations during and outside of wind, wave and stratification events (Gulf of Lion, NW Mediterranean)”, Journal of Marine Systems, 239, 103845 https://doi.org/10.1016/j.jmarsys.2022.103845

2022

• Baudet J.-B., Xuereb B., Duflot A., Poret A., Maniez E., Le Foll F., Coulaud R. (2022). “Temperature-mediated developmental plasticity in winter and summer larvae of Palaemon serratus”, Journal of Thermal Biology, 110, 103343. https://doi.org/10.1016/j.jtherbio.2022.103343 
• Estournel C., Mikolajczak G., Ulses C., Bourrin F., Canals M., Charmasson S., Doxaran D., Duhaut T., Durrieu de Madron X., Marsaleix P., Palanques A., Puig P., Radakovitch O., Sanchez-Vidal A., Verney R. (2022), “Sediment dynamics in the Gulf of Lion (NW Mediterranean Sea) during two autumn-winter periods with contrasting meteorological conditions”, Progress in Oceanography, 210, 102942.  https://doi.org/10.1016/j.pocean.2022.102942
• López Solano C., Turki E.I., Hamdi Y., Soloy A., Costa S., Laignel B., Gutiérrez Barceló Á.D., Abcha N., Jacono D., Lafite R. (2022). “Dynamics of Nearshore Waves during Storms: Case of the English Channel and the Normandy Coasts”, Water, 14, 321. https://doi.org/10.3390/w14030321
• Meslard F., Balouin Y., Robin N., Bourrin F. (2022) “Assessing the Role of Extreme Mediterranean Events on Coastal River Outlet Dynamics”, Water, 14, 2463. https://doi.org/10.3390/w14162463 
• Ody, A.; Doxaran, D.; Verney, R.; Bourrin, F.; Morin, G.P.; Pairaud, I.; Gangloff, A. Ocean Color Remote Sensing of Suspended Sediments along a Continuum from Rivers to River Plumes: Concentration, Transport, Fluxes and Dynamics. Remote Sens. (2022), 14, 2026. https://doi.org/10.3390/rs14092026
• Poppeschi C., Charria G., Daniel A., Verney R., Rimmelin-Maury P., Retho M., Goberville E., Grossteffan E., Plus M. (2022) “Interannual variability of the initiation of the phytoplankton growing period in two French coastal ecosystems”, Biogeosciences, 19, 5667–5687, https://doi.org/10.5194/bg-19-5667-2022
• Qui-Minet, Z. N., Davoult, D., Grall, J., & Martin, S. (2022). The relative contribution of fleshy epiphytic macroalgae to the production of temperate maerl (rhodolith) beds. Marine Ecology Progress Series, 693, 69-82.
• Ratmaya Widya, Laverman Anniet M., Rabouille Christophe, Akbarzadeh Zahra, Andrieux-Loyer Francoise, Barillé Laurent, Barillé Anne-Laure, Le Merrer Yoann, Souchu Philippe (2022). Temporal and spatial variations in benthic nitrogen cycling in a temperate macro-tidal coastal ecosystem: Observation and modeling . Continental Shelf Research , 235, 104649 (18p.) . https://doi.org/10.1016/j.csr.2022.104649
• Roux, P., Siano, R., Souchu, P., Collin, K., Schmitt, A., Manach, S., … & Schapira, M. (2022). Spatio-temporal dynamics and biogeochemical properties of green seawater discolorations caused by the marine dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum along southern Brittany coast. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 275, 107950.
• Serre-Fredj Léon, Léo Chasselin, Orianne Jolly, Franck Jacqueline, Pascal Claquin, (2022) Colimitation assessment of phytoplankton growth using a resource use efficiency approach in the Bay of Seine (French-English Channel), Journal of Environmental Management, 306, 114487,
  ISSN 0301-4797, https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2022.114487.

2021

• Delaval A., Duffa C., Pairaud I., Radakovitch O. (2021). “A fuzzy classification of the hydrodynamic forcings of the Rhone River plume: an application in case of accidental release of radionuclides”. Environmental Modelling & Software, 140, 105005 https://doi.org/10.1016/j.envsoft.2021.105005 [Mesurho]
• Poppeschi C., Charria G., Goberville E., Rimmelin-Maury P., Barrier N., Petton P., Unterberger M., Grossteffan E., Repecaud M., Quemener L., Theetten S., Le Roux J.-F., Treguer P., (2021). “Unraveling Salinity Extreme Events in Coastal Environments: A Winter Focus on the Bay of Brest”, Frontiers in Marine Sciences, 8, 705403 https://doi.org/10.3389/fmars.2021.705403 [Iroise]
• Serre-Fredj L., Jacqueline F., Navon M., Izabel G., Chasselin L., Jolly O., Repecaud M., Claquin P. (2021) “Coupling high frequency monitoring and bioassay experiments to investigate a harmful algal bloom in the Bay of Seine (French-English Channel)”, Marine Pollution Bulletin, 168, 112387 https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2021.112387 [Smile]
• Sotillo, M.G.; Campuzano, F.; Guihou, K.; Lorente, P.; Olmedo, E.; Matulka, A.; Santos, F.; Amo-Baladrón, M.A.; Novellino, A. River Freshwater Contribution in Operational Ocean Models along the European Atlantic Façade: Impact of a New River Discharge Forcing Data on the CMEMS IBI Regional Model Solution. J. Mar. Sci. Eng. 2021, 9, 401. https://doi.org/10.3390/jmse9040401

2020

• Charria, G., P. Rimmelin-Maury, E. Goberville, S. L’Helguen, N. Barrier, C. David-Beausire, T. Cariou, E. Grossteffan, M. Repecaud, L. Quémener, S. Theetten, and P. Tréguer, Temperature and Salinity Changes in Coastal Waters of Western Europe: Variability, Trends and Extreme Events, 2020, In: Evolution of Marine Coastal Ecosystems under the Pressure of Global Changes, H.-J. Ceccaldi et al. (eds.), Springer Nature, doi: 10.1007/978-3-030-43484-7_15. [Iroise]
• Crocker, R., Maksymczuk, J., Mittermaier, M., Tonani, M., and Pequignet, C.: An approach to the verification of high-resolution ocean models using spatial methods, Ocean Sci., 16, 831–845, https://doi.org/10.5194/os-16-831-2020, 2020.
• Derot, J., H. Yajima, F.G. Schmitt, The beneficial impacts of machine learning and sampling frequency on phytoplankton bloom forecast in coastal area, Ecological Informatics, 60, 101174, 2020. [doi:10.1016/j.ecoinf.2020.101174] [Carnot]
• Dumasdelage R., Delestre O., (2020) “Simulating coliform transport and decay from 3D hydrodynamics model and in situ observation in Nice area”, SN Appl. Sci. 2, 1348, https://doi.org/10.1007/s42452-020-3122-4 [EOL]
• Gac JP., Cariou T., Macé É., Vernet M., Bozec Y. (2020) Statistical Analysis of High-Frequency pCO2 Data Acquired with the ASTAN buoy (South-Western English Channel, Off Roscoff). In: Ceccaldi HJ., Hénocque Y., Komatsu T., Prouzet P., Sautour B., Yoshida J. (eds) Evolution of Marine Coastal Ecosystems under the Pressure of Global Changes. Springer, Cham [Astan]
• Gac J-P, Marrec P, Cariou T, Guillerm C, Macé É, Vernet M and Bozec Y (2020) Cardinal Buoys: An Opportunity for the Study of Air-Sea CO2 Fluxes in Coastal Ecosystems. Front. Mar. Sci. 7:712. doi: 10.3389/fmars.2020.00712. [Astan]
• Grassi K., Poisson-Caillault É., Bigand A., Lefebvre A., 2020. Comparative Study of Clustering Approaches Applied to Spatial or Temporal Pattern Discovery. J. Mar. Sci. Eng. 2020, 8, 713. https://doi.org/10.3390/jmse8090713 [Carnot]
• Mikolajczak G., Estournel C., Ulses C., Marsaleix P., Bourrin F., Martín J., Pairaud I., Puig P., Leredde Y., Many G., Seyfried L., Durrieu de Madron X. (2020). Impact of storms on residence times and export of coastal waters during a mild autumn/winter period in the Gulf of Lion. Continental Shelf Research., 207, doi:10.1016/j.csr.2020.104192. [Mesurho]
• Petton Sebastien, Pouvreau Stephane, Dumas Franck (2020). Intensive use of Lagrangian trajectories to quantify coastal area dispersion . Ocean Dynamics , 70(4), 541-559 . https://doi.org/10.1007/s10236-019-01343-6 [Smart]

2019

• Cocquempot L., Delacourt C., Paillet J., Riou P., Aucan J., Castelle B., Charria G., Claudet J., Conan P., Coppola L., Hocdé R., Planes S., Raimbault P., Savoye N., Testut L., Vuillemin R. (2019). “Coastal Ocean and Nearshore Observation: A French Case Study”, Frontiers of Marine Sciences, 6, 324. https://doi.org/10.3389/fmars.2019.00324 
• Farcy P., Durand D., Charria .G, Painting D. J., Tamminem T., Collingridge K., Grémare A. J., Delauney L., Puillat I. (2019) “Toward a European Coastal Observing Network to Provide Better Answers to Science and to Societal Challenges; The JERICO Research Infrastructure”, Frontiers in Marine Sciences, 6, 529, https://doi.org/10.3389/fmars.2019.00529 
• Gourault, M., S. Petton, Y. Thomas, L. Pecquerie, G. M. Marques, C. Cassou, E. Fleury, Y.-M. Paulet, S. Pouvreau, 2019. Modeling reproductive traits of an invasive bivalve species under contrasting climate scenarios from 1960 to 2100, Journal of Sea Research, 143, 128-139.  doi:10.1016/j.seares.2018.05.005. [Smart / « Pointe du château »]
• Lefebvre A., E. Poisson-Caillault, 2019. High resolution overview of phytoplankton spectral groups and hydrological conditions in the eastern English Channel using unsupervised clustering, Marine Ecology Progress Series 608, 73-92. doi:10.1016/j.seares.2018.05.005 [Marel Carnot]
• Ménesguen, A., M. Dussauze, F. Dumas, B. Thouvenin, V. Garnier, F. Lecornu, M. Répécaud, Ecological model of the Bay of Biscay and English Channel shelf for environmental status assessment part 1: Nutrients, phytoplankton and oxygen, Ocean Modelling, 133, 56-78, doi:10.1016/j.ocemod.2018.11.002, 2019. [Molit]
• Phan Thi-Thu-Hong, Poisson Caillault Émilie, Lefebvre Alain, Bigand André (2020). Dynamic Time Warping-based imputation for univariate time series data. Pattern Recognition Letters, 139, 139-147. Publisher’s official version : https://doi.org/10.1016/j.patrec.2017.08.019 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00396/50696/ [Carnot]

2018

• Phan H., A. Bigand, Poisson Caillault E., 2018. A new fuzzy logic based similarity measure applied to large gap imputation for uncorrelated multivariate time series, Applied Computational Intelligence and Soft Computing, 2018, 9095683. [Marel Carnot]

2022

• Delaval A., Duffa C., Pairaud Ivane, Radakovitch O. (2022). “Dracar: An Estuarine Transfer Function to Predict Dissolved Pollutant Fluxes to the Sea. Application for Radionuclides”, In: Advances in Hydroinformatics, P. Gourbesville and G. Caignaert (eds), pp.1115-1129.
• Träsch, M., Raillard, N., Perier, V., Le Boulluec, M., Répécaud, M., & Matoug, C. (2022). Metocean conditions at the Ifremer in situ test site in Brest. Trends in Renewable Energies Offshore, 77-85. [Marel Iroise]

2020

• Charria G., Rimmelin-Maury P., Goberville E., L’Helguen S., Barrier N., David-Beausire C., Cariou T., Grossteffan E., Repecaud M., Quémener L., Theetten S., and Tréguer T. (2020). “Temperature and Salinity Changes in Coastal Waters of Western Europe: Variability, Trends and Extreme Events”, In: Evolution of Marine Coastal Ecosystems under the Pressure of Global Changes, H.-J. Ceccaldi et al. (eds.), Springer Nature, pp. 207-226. https://doi.org/10.1007/978-3-030-43484-7_15 
• Gac J.P., Cariou T., Macé É., Vernet M., Bozec Y. (2020) “Statistical Analysis of High-Frequency pCO2 Data Acquired with the ASTAN buoy (South-Western English Channel, Off Roscoff)”. In: Ceccaldi HJ., Hénocque Y., Komatsu T., Prouzet P., Sautour B., Yoshida J. (eds) Evolution of Marine Coastal Ecosystems under the Pressure of Global Changes. Springer, Cham

2019

• Grassi K., Poisson-Caillault E., Lefebvre A., 2019. Multi-level spectral clustering for extreme event characterization. MTS/IEEE OCEANS ’19, Proceedings of Oceans 2019, IEEE. 6p, 17-20 juin, Marseille, France  [Marel Carnot]
• Repecaud M., Quemener L., Charria G., Pairaud I., Rimmelin P., Claquin P., Jacqueline F., Lefebvre A., Facq J.V., Retho M., Verney R., 2019. National observation infrastructure : an example of a fixed-platforms network along the French coast : COAST HF. MTS/IEEE OCEANS ’19, Proceedings of Oceans 2019, IEEE. 6p, 17-20 juin, Marseille, France [Réseau COAST-HF]
• Rérolle, V., D. Angelescu, A. Hausot, P. Ea, N. Lefèvre, C. Provost, M. Labaste, Development of a novel hybrid pH sensor for deployment on autonomous profiling platforms, MTS/IEEE OCEANS ’19, Proceedings of Oceans 2019, IEEE. 6p, 17-20 juin, Marseille, France [Marel Iroise]

2018

• Phan T.-T.-H., Poisson Caillault E., Bigand A., 2018. Comparative study on univariate forecasting methods for meteorological time series. 26^th European Signal Processsing Conference (EUSIPCO), pp.2380-2384. ISBN 978-90-827970-1-5  [Marel Carnot]

Thèses soutenues (2019-2023) par date de soutenance

• Marion Chapalain, “Dynamique des matières en suspension en mer côtière : caractérisation, quantification et interactions sédiments/matière organique”. Thèse de l’UBO, soutenue le 28 janvier 2019. Directeur de thèse : Pierre Le Hir. https://theses.fr/2019BRES0010 
• Kelly Grassi, “Caractérisation de la dynamique de la biomasse phytoplanctonique par définition d’états environnementaux multicritères avec apprentissage profond semi-supervisé et classification spectrale à partir de données hautes fréquences”. Thèse de l’ULCO, soutenue le 19 novembre 2020. Directeur de thèse : Lefebvre A. (Ifremer). Encadrants : Poisson-Caillault E., Bigand A. (ULCO/LISIC). https://theses.fr/2020DUNK0585 
• Jean-Philippe Gac, “Etude multi-échelles des échanges air-mer de CO2 et de l’acidification océanique en Manche occidentale”. Thèse de Sorbonne Université soutenue le 27 septembre 2021. Directeurs de thèse: Yann Bozec, Pascal Morin. https://theses.fr/2021SORUS223 
• Adrien Delaval, “Modélisation du transfert de 137Cs dans le continuum fleuve-mer Rhône-Méditerranée”. Thèse de l’Université Aix Marseille soutenue le 22 octobre 2021. Directeurs de thèse: Olivier Radakovitch, Céline Duffa. https://theses.fr/2021AIXM0389 
• Elise Vissenaekens, “The assessment of the uncertainty of the hydrodynamical SYMPHONIE2015 model and its implications for Lagrangian dispersal studies”. Thèse de Sorbonne Université, soutenue le 27 janvier 2022. Directrice de thèse: Katell Guizien. https://theses.fr/2022SORUS039 
• Mathieu Luthier, “Plasticité phénotypique des huîtres à l’acidification des océans en milieux tempéré et tropical”. Thèse de l’UBO, soutenue le 24 février 2022. Directeur de thèse: Fabrice Pernet. https://theses.fr/2022BRES0011 
• Rémi Caillibotte, “Impact des tempêtes et des crues sur les écosystèmes marins côtiers : Approche par modélisation couplée hydrodynamique-biogéochimique”. Thèse de l’Université de Montpellier, soutenue le 20 septembre 2022. Directeurs de thèse: Yann Leredde, Behzad Mostajir. https://theses.fr/2022UMONG084
• Leon Serre-Fredj, “Production primaire et dynamique phytoplanctonique le long d’un gradient d’eutrophisation : Continuum estuaire-baie de Seine”. Thèse de l’Université Caen Normandie soutenue le 23 juin 2022. Directeur de thèse : Pascal Claquin. https://theses.fr/2022NORMC234 
• Colline Poppeschi, “Vers la compréhension des réponses de l’environnement côtier aux événements extrêmes dans un contexte de changement climatique”. Thèse de l’UBO soutenue le 13 octobre 2023. Directeurs de thèse: Guillaume Charia, Romaric Verney. https://theses.fr/2023BRES0044 

Thèses en cours (2024)

• Raed Halawi Ghosn (2021-2024). “Machine Learning et Phytoplancton nuisible : définition des états environnementaux favorables aux efflorescences et de leurs dynamiques, et développement d’un système numérique expert de prévision, d’alerte et d’aide à la décision”. Thèse de l’ULCO. Directeur de thèse : Alain Lefebvre (LER-BL, Boulogne-sur-Mer). Encadrants : Emilie Poisson-Caillault (LISIC, Calais) ; Charria G. (LOPS, Brest). Soutenance prévue en octobre 2024. https://theses.fr/s305428 
• Kevin Robache (2022-2025). “Analyses multi-échelles de séries temporelles de pCO2 océaniques et atmosphériques et de leur différence”. Thèse de l’ULCO. Directeur de thèse: F. Schmitt (LOG, Wimereux). https://www.theses.fr/s344676
• Harshal Chavan (2023-2026). “Impact des tempêtes sur l’environnement marin et les communautés phytoplanctoniques dans la Manche”. Thèse de l’ULCO. Directeurs de thèse: F. Schmitt, U. Christaki (LOG, Wimereux). https://theses.fr/s372544
• Lise Delatte (2023-2026). “Eutrophisation et dystrophie en baie de seine : Impacts sur la structure des communautés phytoplanctoniques et leur productivité”. Thèse de l’Université de Caen Normandie. Directeur de thèse: Pascal Claquin (BOREA, Luc sur Mer). https://theses.fr/s368856
• Maud Martinez Almoyna Carlhand (2023-2026). “Evolution des écosystèmes côtiers sous influence des fleuves dans le golfe de Gascogne et la Manche durant le 21e siècle”. Thèse de l’UBO. Directeurs de thèse: Guillaume Charia (LOPS, Brest), Marc Sourisseau (DYNECO, Brest). https://theses.fr/s385278 
• Ocea Van Loenen (2023-2026). “ Impact des évènements extrêmes sur les transferts de matière et le fonctionnement des écosystèmes à l’embouchure du Rhône : crues, tempêtes et vagues de chaleur”. Thèse de l’Université de Paris Saclay. Directeurs de thèse: Christophe Rabouille (LSCE, Gif-sur-Yvette), Ivane Pairaud (LOPS, Brest), François Bourrin (CERFREM, Perpignan). https://theses.fr/s366775
• Mathilde Couteyen (2024-2027). “Contribution des micro-organismes aux indicateurs BEE Habitats pélagiques de la DCSMM : Cas d’étude des analyses par cytométrie en flux en Méditerranée occidentale “. Directeurs de thèse : Gérald Grégori (MIO, Marseille) et David Nérini (MIO, Marseille). https://theses.fr/s386098